Theo quy định tại khoản 5 Điều 17 Nghị định 68/2026/NĐ-CP của Chính phủ, đối với hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh nộp thuế theo phương pháp khoán từ năm 2025 trở về trước và đã được xác định mức thuế khoán (bao gồm cả trường hợp hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh có thay đổi về quy mô sản xuất kinh doanh dẫn đến doanh thu khoán thuế thay đổi từ 50% trở lên) theo quy định của Luật Quản lý thuế 2019 và các văn bản hướng dẫn thi hành, khi chuyển sang thực hiện kê khai thuế kể từ ngày 01/01/2026, cơ quan thuế không sử dụng doanh thu khai thuế năm 2026 để xác định lại nghĩa vụ thuế các năm trước, không xử phạt vi phạm hành chính đối với các nghĩa vụ thuế đã thực hiện theo phương pháp khoán, trừ trường hợp cơ quan thuế, cơ quan nhà nước có thẩm quyền phát hiện hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh có hành vi che giấu doanh thu dẫn đến thiếu số thuế phải nộp.
Như vậy, theo quy định nêu trên, từ 2026 hộ kinh doanh sẽ chuyển từ thuế khoán sang kê khai, các hộ kinh doanh đã nộp thuế theo phương pháp khoán trước năm 2026 sẽ không bị truy thu hay xử phạt đối với các nghĩa vụ đã thực hiện, trừ trường hợp có hành vi che giấu doanh thu. Đồng thời, doanh thu kê khai từ năm 2026 cũng không được sử dụng để xác định lại nghĩa vụ thuế của các năm trước.
Chính sách chấm dứt phương pháp thuế khoán từ năm 2026 thể hiện định hướng thay đổi rõ ràng trong quản lý thuế đối với hộ kinh doanh. Đây là bước chuyển phù hợp với xu hướng minh bạch hóa. Tuy nhiên, thách thức lớn nằm ở khả năng thích ứng của hộ kinh doanh. Phần lớn các hộ nhỏ lẻ chưa có thói quen ghi chép sổ sách, chưa quen với việc kê khai và sử dụng công cụ điện tử. Các cá nhân, hộ kinh doanh cần quan tâm, cập nhật kịp thời các quy định của pháp luật để hạn chế rủi ro phát sinh trong quá trình sản xuất, kinh doanh.
